Bakterielles interaktioner med mennesker: Patogene, kommensale, mutualistiske og økologiske roller

Bakterier indgår i diverse relationer med mennesker:

1. Patogene: Forårsager sygdom via toksiner, invasion, immunundvigelse. Eksempler: S. pneumoniae (pneumoni), M. tuberculosis, V. cholerae, Salmonella, C. difficile.
2. Kommensale: Koloniserer uden skade; har fordel af værtsniche. Hud (Staph epidermidis), oral (viridans streptokokker), tarm (Bacteroides). Kan blive opportunistiske hvis barriere brydes.
3. Mutualistiske: Begge har fordel. Tarm mikrobiota: fermenterer fiber → SCFA'er (butyrat til colonocytter), syntetiserer vitamin K₂, B₁₂, biotin; træner immunsystem; modvirker kolonisering af patogener; regulerer metabolisme.
4. Miljømæssige/økologiske: Nedbryder organisk stof, nitrogenfixering (rhizobier), bioremediation, oxygenisk fotosyntese (cyanobakterier – old oprindelse af kloroplaster).

Det humane mikrobiom (10¹⁴ mikrober, ~3.000 arter) er et virtuelt organ der påvirker immunitet, metabolisme, neuroadfærd og medicinrespons. Dysbiose linker til IBD, fedme, diabetes, autism, depression, allergi.