Alle immunogener er antigener, men alle immunogener?

Ikke alle antigener er immunogener. Et immunogen er et antigen, der er i stand til at stimulere et immunrespons, mens et antigen er ethvert stof, der genkendes af immunsystemet. Nogle antigener er ikke immunogene, enten fordi de ikke er i stand til at blive bearbejdet af immunsystemet, eller fordi de ikke indeholder de nødvendige molekylære strukturer til at udløse et immunrespons. For eksempel er nogle polysaccharider antigener, men er ikke immunogene, mens nogle proteiner er både antigener og immunogener.