Konverter CNS-kort til CCP4: Trin-for-trin guide

CNS er en gruppe programmer skabt af en gruppe universiteter. Det analyserer og opretter kort til krystallografi og NMR i det medicinske felt. Et andet program, der udfører samme funktion, er CCP4. Dog gemmer disse to programmer deres filer med to forskellige filtypenavne. Konvertering af CNS-kort til CCP4-kort kræver forståelse af, hvordan man bruger USF's MAPMAN-program. Du skal kunne bruge kommandolinjen i dette program til at skrive de specifikke, nødvendige kommandoer.

Instruktioner

1. Åbn MAPMAN og vælg "Command Line"-indstøbningen fra den øverste menu. Det åbner en kommandolinje-baseret programmeringsmetode.

2. Skriv "read m1 ${prefix}_1fofc.map CNS" i den første kommandolinje. Erstat "${prefix}" med basispath og filnavnet på dit CNS-kort. Tryk "Enter" for at gå til næste linje.

3. Indtast linjen "read m2 ${prefix}_2fofc.map CNS" og indtast basispath og filnavn for det andet kort, du vil konvertere. Tryk "Enter" for at gå til næste linje. Tilføj så mange kort, du vil konvertere.

4. Skriv "write m1 ${prefix}_1fofc.map CCP4" på næste linje, erstat "${prefix}" med basispath og filnavnet, hvor du vil gemme dit konverterede kort. Tryk "Enter" og tilføj en ny linje på samme måde for hvert kort, du konverterer.

5. Indtast "quit" som din sidste linje og tryk "Enter". Vent på, at programmet kører, og tjek så basispathen, hvor du gemte dine konverterede kort. Sørg for, at dine konverterede kort blev gemt her. Åbn de nye kort med CCP4.