Virusklassificering: Genom, struktur og transmissionstyper

Virusser klassificeres efter genomtype (DNA/RNA, enkelt- eller dobbeltstrenget, sense), kapsid symmetri, hylle tilstedeværelse og replikationsstrategi. Baltimore-klassifikationen (7 grupper) er guldstandarden for genombaseret taxonomi.

Baltimore-klassificering (genomcentreret)

Gruppe	Genom	Eksempler	Replikationsbemærkninger
I	dsDNA	Herpesvirus, Adenovirus, Poxvirus	Replikerer i kerne (ved det meste)
II	ssDNA	Parvovirus, Circovirus	Konverteres til dsDNA-intermediat
III	dsRNA	Rotavirus, Reovirus	Replikerer i cytoplasma; RNA-afhængig RNA-polymerase
IV	(+)ssRNA	Poliovirus, HCV, Coronavirus (SARS-CoV-2)	Genom = mRNA; direkte translation
V	(-)ssRNA	Influenza, Mæslinger, Rabies, Ebola	Kræver viral RdRp til at lave (+)RNA
VI	ssRNA-RT (Retrovirusser)	HIV, HTLV-1	Reverse transcriptase → DNA → integration
VII	dsDNA-RT	Hepatitis B	RNA-intermediat → revers transkription

Strukturel klassificering

• Hyllede: Lipidbilag fra værtsmembran (HIV, Influenza, HSV, HBV). Følsomme over for detergenter, tørring.
• Ikke-hyllede (nakne): Kun proteinkapsid (Poliovirus, Adenovirus, Norovirus). Mere stabile i miljøet.

Transmissionsveje

• Respiratoriske dråber/aerosoler (Influenza, SARS-CoV-2, Mæslinger)
• Fekal-oral (Norovirus, Rotavirus, Poliovirus, HAV)
• Blod/seksuel (HIV, HBV, HCV)
• Vektorbåren (Dengue, Zika, Gul feber – myg)
• Direkte kontakt (HSV, HPV, Molluscum)

Hvorfor klassificering betyder noget

Vejelegger antivirale mål (polymeraser, proteaser, indtrædelse), vaccinedesign (hylleproteiner) og smittekontrol (hyllede = lettere at desinficere).