Hvad sker der med pepsinen, der kommer ind i tyndtarmen?

Pepsinet, der kommer ind i tyndtarmen, inaktiveres af tyndtarmens alkaliske pH. Pepsin er en sur protease, der fungerer optimalt i det sure miljø i maven. Når det kommer ind i tyndtarmen, som har en pH på omkring 8, mister det sin aktivitet og er ikke længere i stand til at nedbryde proteiner. Bugspytkirtlen udskiller også bikarbonat-ioner i tyndtarmen, hvilket yderligere hjælper med at neutralisere den sure chyme og skabe et miljø, der er mere velegnet til de andre fordøjelsesenzymer, såsom bugspytkirtelproteaser og lipaser.