Sådan Konverter Sequence til Fasta
Et fælles mål i medicinsk forskning indebærer identifikation af fejl, eller mutationer i DNA-sekvens , som kan forårsage genetiske sygdomme. Teknologi og datalogi har avancerede genetiske forskning til et niveau, hvor tusindvis af sekvens data kan analyseres samtidigt. En bestemmelse af nyere software er forudgående konvertering af sekvens data i FASTA format. FASTA ligner simpel tekst -format. Det giver flere stykker af data , der skal udarbejdes i en enkelt fil og accelererer analyse. Men de fleste instrumenter generere sekvens filer i tekst -format. Konvertering tekst til FASTA format er en simpel proces med tekst editor software . Hvad du har brugcomputer
tekst editor program myHotelVideo.com: Vis Flere Instruktioner
1
Åbn den udpegede DNA-sekvens tekstfil ved hjælp af tekst - redigering program . Dette ville være Text Editor til Macintosh og Notesblok til Windows kompatible systemer . Oprindelige sekvens tekstfiler kan have en alternativ udvidelse såsom seq for data, der genereres på en Applied Biosystems automatiseret genetiske analysator .
2
Begynd den første linje ved at skrive > efterfulgt af en sekvens id. Jo større end symbol betegner FASTA format for programmer, der kan analysere FASTA data. Der er ingen specifikke regler om identifikation , så længe der ikke er mellemrum . Et eksempel på en acceptabel indgang for den første linje er> Cat_Isomerase_Exon3 .
3
Tryk på " Return "-tasten for at indsætte et linjeskift og begynde den anden linje.
< Br > 4
Begynd sekvens data på linie to. FASTA retningslinjer format kræver DNA tekstdata efter Internationale Union for Ren og Anvendt Kemi , IUPAC , koder . Hver linje er begrænset til 80 tegn , der repræsenterer 80 DNA-baser og kan være store eller små bogstaver . En acceptabel post herunder blandet baser er AGCTTCGTGG ... CVTGCGTTGT .
5.
Tryk på " Return "-tasten for at begynde den næste linje af sequencer-data. Hver linje bør bestå af 80 baser repræsenteret ved IUPAC koden.
6
Gem filen ved hjælp af txt -fil forlængelse eller passende FASTA filtype . Programmer, der behandler FASTA formaterede data kræver ofte en FASTA bestemt lokalnummer såsom fsa , fna , ffn eller FRN .
Hoteltilbud
Relaterede Sundhed Artikler